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Publications

[5] Chion, M., Carapito, C. & Bertrand, F. (2022). Towards a more accurate differential analysis of multiple imputed
proteomics data with mi4limma. Statistical Analysis of Proteomic Data: Methods and Tools. Ed. by T. Burger. Vol. 2426,
Methods in Molecular Biology, Humana Press, in press, 2022.

[4] Chion, M., Carapito, C. & Bertrand, F. (2021). Accounting for multiple imputation-induced variability for differential
analysis in mass spectrometry-based label-free quantitative proteomics. arXiv:2108.07086.

[3] Bons, J., Husson, G., Chion, M., Bonnet, M., Maumy‐Bertrand, M., Delalande, F., Cianférani, S., Bertrand, F., Picard, B.
& Carapito, C. (2021). Combining label‐free and label‐based accurate quantifications with SWATH‐MS: comparison
with SRM and PRM for the evaluation of bovine muscle type effects. Proteomics.

[2] Quibel, L., Helluy, P., Chion, M. & Ricka, P. (2019). Mélanger des gaz raides pour créer de nouvelles lois d’état. hal-02114552.

[1] Muller, L., Fornecker, L., Chion, M., Van Dorsselaer, A., Cianférani, S., Rabilloud, T. & Carapito, C. (2018). Extended
investigation of tube-gel sample preparation : a versatile and simple choice for high throughput quantitative proteomics.
Scientific Reports. 8:8260.

Oral communications

Marie Chion, Joanna Bons, Muriel Bonnet, Myriam Maumy-Bertrand, Christine Carapito & Frédéric Bertrand: Modèle de régression
par spline monotone pour données de protéomique quantitative. 52e Journées de Statistique – June 7-11, 2021 – Online.

Marie Chion, Joanna Bons, Muriel Bonnet, Myriam Maumy-Bertrand, Christine Carapito & Frédéric Bertrand: Using monotone spline
smoothing to combine label-free and label-based accurate quantifications with DIA-MS: application to bovine muscle samples.
e-Chimiométrie 2021 – February 2-3, 2021 – Online.

Marie Chion: Developing statistical methodologies for quantitative proteomics. Journées du LabEx IRMIA – October 7, 2020 –
Strasbourg, France.

Marie Chion, Christine Carapito & Frédéric Bertrand : Dealing with imputation-caused variance using moderated t-test. UseR! 2020 –
Cancelled due to COVID-19.

Marie Chion, Christine Carapito & Frédéric Bertrand: Développement de nouvelles méthodologies d’analyse de données protéomiques.
Journée de rentrée de l’École Doctorale 269 – October 8, 2019 – Strasbourg, France.

Marie Chion, Christine Carapito & Frédéric Bertrand: Imputation multiple et prise en compte de l'incertitude pour les données de
protéomique quantitative. 51e Journées de Statistique – June 3-7, 2019 – Nancy, France.

Poster communications

Marie Chion, Christine Carapito & Frédéric Bertrand : Dealing with imputation-caused variance in label-free quantitative proteomics data.
May Institute on Computation and statistics for mass spectrometry and proteomics at Northeastern University – April 27 -  May 8, 2020 –
Boston, MA, États-Unis.

Marie Chion, Christine Carapito & Frédéric Bertrand : Imputation multiple et prise en compte de l'incertitude pour les données de
protéomique quantitative. Journées Statistique & Santé – October 10-11, 2019 – Paris, France.

Marie Chion, Christine Carapito & Frédéric Bertrand : Développement de nouvelles méthodologies d’analyse de données protéomiques.
Journée de rentrée de l’École Doctorale 269 – October 8, 2019 – Strasbourg, France.

Marie Chion, Leslie Muller, Nicolas Pythoud, Frédéric Bertrand et Christine Carapito: Dealing with imputation-caused variance in
label-free quantitative proteomics data. SMAP 2019 – September 16-19, 2019 – Strasbourg, France.

Marie Chion, Christine Carapito & Frédéric Bertrand: Imputation multiple et prise en compte de l'incertitude pour les données de
protéomique quantitative. 1er Symposium du Groupement de Recherche MaDICS – June 26-28, 2019 – Rennes, France.